Avrupa Birliği çok çeşitli finansman araçları sağlamaktadır. Bunlar da hedefler, temalar, öncelikler, sorumluluklar ve katılımcılardan oluşan geniş bir yelpaze oluşturmaktadır. Avrupa Birliği, Bonn Federal Belediyesini devam eden projeler için 5.3 milyon Avro ile desteklemektedir. Bu da tüm finansmanın yaklaşık yüzde beşinin Brüksel'den geldiği anlamına geliyor. "Veri odaklı ekonomi ve toplum" ya da "Kadın ve Çalışma için Yetkinlik Merkezi "nin genişletilmesi ve "Bölgesel İklim Değişikliği Stratejisi" gibi tedbirler desteklenmektedir.

Bonn'da Avrupa fonları "Sosyal Bütünleştirici Tannenbusch Şehri" gibi sosyal projelere, "Yeşil C" gibi yeşil altyapının genişletilmesine ya da Bonn BM Şehrinin geliştirilmesine aktarılmaktadır. AB finansmanı özellikle bilim ve araştırma için önemlidir. Rheinische Friedrichs-Wilhelm Üniversitesi ve bölgedeki çok sayıda yüksek öğrenim kurumu Brüksel'den gelen fonlara bağımlıdır. Buna Sankt Augustin'deki Fraunhofer Bilgi Teknolojileri Enstitüsü de dahildir. Bonn şehri, Kopenhag ve Torino ile birlikte, büyük etkinliklerin güvenliğiyle ilgili Avrupa çapındaki araştırma projesi MONICA'da proje ortağı olarak yer almaktadır.

Şehir yönetiminin dahil olduğu tüm Bonn finansman projeleri ayrı bir veri tabanına kaydedilmektedir. Gelecekteki bu görevi koordine etmek ve destek ve tavsiye sağlamak için bir şehir finansman departmanı kurulmuştur.