Европейский союз предоставляет широкий спектр инструментов финансирования. Они, в свою очередь, формируют широкий спектр целей, тем, приоритетов, обязанностей и участников. Европейский союз поддерживает федеральный город Бонн, выделяя 5,3 миллиона евро на текущие проекты. Это означает, что около пяти процентов всего финансирования поступает из Брюсселя. Поддерживаются такие мероприятия, как расширение "экономики и общества, основанных на данных" или "Центра компетенции по вопросам женщин и работы", а также "Региональная стратегия по изменению климата".

В Бонне европейское финансирование было направлено на социальные проекты, такие как "Социально интегрированный город Танненбуш", расширение зеленой инфраструктуры, например, "Зеленый C" или развитие города ООН в Бонне. Финансирование ЕС особенно важно для науки и исследований. Рейнский университет имени Фридриха Вильгельма и многочисленные высшие учебные заведения региона зависят от финансирования из Брюсселя. К ним относится и Институт информационных технологий Фраунгофера в Сант-Августине. Вместе с Копенгагеном и Турином город Бонн участвует в качестве партнера по проекту в общеевропейском исследовательском проекте MONICA, который занимается вопросами безопасности крупных мероприятий.

Все финансируемые Бонном проекты, в которых участвует администрация города, заносятся в отдельную базу данных. Для координации этой будущей задачи и оказания поддержки и консультаций был создан городской отдел финансирования.