Unia Europejska zapewnia szeroki wachlarz instrumentów finansowania. Te z kolei tworzą szerokie spektrum celów, tematów, priorytetów, obowiązków i uczestników. Unia Europejska wspiera miasto federalne Bonn kwotą 5,3 mln euro na bieżące projekty. Oznacza to, że około pięć procent wszystkich funduszy pochodzi z Brukseli. Wspierane są takie działania, jak ekspansja "gospodarki i społeczeństwa opartego na danych" lub "Centrum Kompetencji Kobiet i Pracy", a także "Regionalna strategia przeciwdziałania zmianom klimatycznym".

W Bonn fundusze europejskie zostały skierowane na projekty społeczne, takie jak "Społecznie zintegrowane miasto Tannenbusch", rozbudowa zielonej infrastruktury, takiej jak "Green C" lub rozwój miasta ONZ w Bonn. Fundusze UE są szczególnie ważne dla nauki i badań. Uniwersytet Rheinische Friedrichs-Wilhelm i liczne instytucje szkolnictwa wyższego w regionie są zależne od finansowania z Brukseli. Dotyczy to również Instytutu Technologii Informacyjnych Fraunhofera w Sankt Augustin. Wraz z Kopenhagą i Turynem, miasto Bonn jest zaangażowane jako partner projektu w ogólnoeuropejski projekt badawczy MONICA, który dotyczy bezpieczeństwa dużych wydarzeń.

Wszystkie projekty finansowane przez Bonn, w które zaangażowana jest administracja miasta, są rejestrowane w osobnej bazie danych. W celu koordynacji tego przyszłego zadania oraz zapewnienia wsparcia i doradztwa utworzono miejski departament ds. finansowania.