Η συμφωνία για τη διατήρηση των μικρών κητωδών της Βαλτικής και της Βόρειας Θάλασσας (ASCOBANS) συνήφθη το 1991 υπό την αιγίδα της CMS. Από τον Ιανουάριο του 2007, η γραμματεία της μητρικής σύμβασης ASCOBANS, η CMS (Γραμματεία της Σύμβασης για τη διατήρηση των μεταναστευτικών ειδών άγριων ζώων), ενεργεί ως γραμματεία της συμφωνίας.

Η κοινή γραμματεία, την οποία διαχειρίζεται το Πρόγραμμα Περιβάλλοντος των Ηνωμένων Εθνών (UNEP), εδρεύει στη Βόννη. Εκτελεί τα απαραίτητα διοικητικά καθήκοντα, συλλέγει και διαδίδει πληροφορίες σχετικά με την εφαρμογή της συμφωνίας, προετοιμάζει και οργανώνει τις συνεδριάσεις των οργάνων λήψης αποφάσεων και των συμβουλευτικών οργάνων της συμφωνίας. Η Γραμματεία διεξάγει επίσης δραστηριότητες για την ευαισθητοποίηση του κοινού σχετικά με τους κινδύνους στους οποίους εκτίθενται τα μικρά κητώδη.