La cooperazione regionale si è affermata come uno strumento importante per la città di Bonn, al fine di garantire in modo sostenibile la sua posizione come sede di attività economiche. La città di Bonn e il distretto Rhein-Sieg, così come molti comuni appartenenti al distretto, lavorano a stretto contatto in settori che vanno dall'istruzione e lo sviluppo di manodopera qualificata alla cooperazione nella pianificazione dei trasporti e nello sviluppo del territorio, nella protezione dell'ambiente e nei servizi comuni. Da oltre due decenni esiste una cooperazione regionale con la regione di Bonn/Rhein-Sieg/Ahrweiler, che abbraccia due Stati federali. Non si tratta solo di partecipazioni a fiere congiunte (come la fiera immobiliare Expo Real), ma anche di rapporti di lavoro collaudati e di lunga data per sostenere i cambiamenti strutturali negli approcci dei cluster (come l'industria sanitaria o la geoinformazione) e nella cooperazione tra imprese e scienza ("Bonn Science Region").