تم إبرام اتفاقية الحفاظ على تجمعات الخفافيش الأوروبية (EUROBATS) في عام 1991 تحت رعاية اتفاقية حفظ أنواع الخفافيش في أوروبا وشمال أفريقيا والشرق الأوسط بعد أن تم الاعتراف بعدم كفاية حالة الحفاظ على الخفافيش في أوروبا وشمال أفريقيا والشرق الأوسط. وتحمي الاتفاقية 52 نوعاً معروفاً من الخفافيش في هذه المنطقة. وحتى الآن، انضمت 35 دولة من أصل 63 دولة مجاورة إلى الاتفاقية. الهدف الرئيسي للاتفاقية هو إنشاء إطار عمل للدول الأعضاء والدول التي لم تنضم بعد للتعاون في حماية أنواع الخفافيش.

وقد بدأت أمانة الاتحاد الأوروبي للخفافيش عملها في بون في عام 1996. وتشمل مهامها تنسيق وتنظيم جميع أنشطة اللجان الدائمة والاستشارية ومؤتمرات الأطراف. كما تتخذ الأمانة أيضاً مبادرات لتنفيذ الاتفاقية، وتجنيد دول أعضاء إضافية، وتعزيز الوعي العام، وتبادل المعلومات وتنسيق مبادرات البحث والرصد الدولية.

وفي عام 2001، أُدمجت الاتفاقية في برنامج الأمم المتحدة للبيئة. وتعتبر الاتفاقية نموذجاً ناجحاً في الترويج لاتفاقيات مماثلة للحفاظ على الخفافيش في قارات أخرى.