Lo sviluppo urbano sta causando un continuo aumento delle superfici impermeabilizzate e la conseguente perdita di suoli naturali e quasi naturali. Il compito della città nell'ambito della protezione del suolo si esplica principalmente nella gestione dei siti contaminati.

I siti contaminati sono stati sistematicamente registrati e studiati a Bonn a partire dal 1985. Mentre l'attenzione iniziale era rivolta alle vecchie discariche, da allora sono stati inclusi anche i siti contaminati (ex siti industriali e commerciali). I siti sospetti di essere contaminati sono riassunti in un registro dei siti contaminati. È possibile ottenere informazioni sui singoli siti presso l'Autorità ambientale inferiore.